Na Konohu zaútočí záhadní létající ninjové ze země Oblohy (Sora no Kuni) zničené za druhé velké války ninjů. Během jejich náletu Naruto potkává doktora Shinnou, který pomáhá zraněnému. Později v nemocnici se seznámí i s jeho mladou žačkou Amaru, která se po doktorovi...
Kritiky vysoce ceněné, výtvarně nesmírně působivé, zároveň však hluboce temné anime se odehrává v polovině 15. století, v době kdy katastrofy a válečné běsnění proměnili Japonsko bezmála v zemi duchů. Hladem umírající matce se narodí chlapec, který dostane do vínku...